Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Nek9Q8K1R7 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek9Q8K1R7 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Nek9Q8K1R7 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Nek9Q8K1R7 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Nek9Q8K1R7 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Nek9Q8K1R7 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Nek9Q8K1R7 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Nek9Q8K1R7 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Nek9Q8K1R7 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Nek9Q8K1R7 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Nek9Q8K1R7 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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