Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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FgbQ8K0E8 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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FgbQ8K0E8 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms