Protein–RNA interactions for Protein: Q61045

Sim1, Single-minded homolog 1, mousemouse

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sim1Q61045 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sim1Q61045 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sim1Q61045 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sim1Q61045 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sim1Q61045 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sim1Q61045 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sim1Q61045 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sim1Q61045 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sim1Q61045 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sim1Q61045 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sim1Q61045 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sim1Q61045 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sim1Q61045 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sim1Q61045 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sim1Q61045 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sim1Q61045 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sim1Q61045 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sim1Q61045 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sim1Q61045 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Sim1Q61045 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sim1Q61045 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Sim1Q61045 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sim1Q61045 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sim1Q61045 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sim1Q61045 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Sim1Q61045 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Sim1Q61045 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sim1Q61045 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Sim1Q61045 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Sim1Q61045 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sim1Q61045 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sim1Q61045 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Sim1Q61045 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13□□□□□ -0.33
Sim1Q61045 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sim1Q61045 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sim1Q61045 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sim1Q61045 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sim1Q61045 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sim1Q61045 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sim1Q61045 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sim1Q61045 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Sim1Q61045 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sim1Q61045 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sim1Q61045 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sim1Q61045 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sim1Q61045 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sim1Q61045 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sim1Q61045 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Sim1Q61045 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Sim1Q61045 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Sim1Q61045 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sim1Q61045 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sim1Q61045 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Sim1Q61045 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Sim1Q61045 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sim1Q61045 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sim1Q61045 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Sim1Q61045 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Sim1Q61045 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sim1Q61045 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sim1Q61045 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sim1Q61045 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sim1Q61045 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sim1Q61045 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Sim1Q61045 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sim1Q61045 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sim1Q61045 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sim1Q61045 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Sim1Q61045 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sim1Q61045 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sim1Q61045 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sim1Q61045 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sim1Q61045 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sim1Q61045 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sim1Q61045 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sim1Q61045 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sim1Q61045 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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