Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF39

MFSD4B, Sodium-dependent glucose transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD4BQ5TF39 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MFSD4BQ5TF39 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms