Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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