Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Gm15218-201ENSMUST00000131006 618 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Gm37973-201ENSMUST00000195767 1289 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 1700124M09Rik-201ENSMUST00000217047 305 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Araf-202ENSMUST00000120356 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Gm43747-201ENSMUST00000201412 1330 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Ctdspl2-203ENSMUST00000110574 1616 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Gm20574-201ENSMUST00000182867 917 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 4930540E01Rik-201ENSMUST00000192569 1146 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Gm38039-201ENSMUST00000195328 443 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Gm43708-201ENSMUST00000198857 961 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Gm44809-201ENSMUST00000208305 993 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Fsip1-201ENSMUST00000028820 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 C2cd6b-201ENSMUST00000054653 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Gm28649-201ENSMUST00000189153 1581 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Olfr1292-ps1-201ENSMUST00000118137 939 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms