Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLIP1P30622 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms