Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Ggta1P23336 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Ggta1P23336 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Ggta1P23336 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Ggta1P23336 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Ggta1P23336 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Ggta1P23336 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Ggta1P23336 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms