Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Derl3Q9D8K3 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.1 ms