Protein–RNA interactions for Protein: Q99N09

Ms4a6b, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6B, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6bQ99N09 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ms4a6bQ99N09 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms