Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg16l2Q6KAU8 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg16l2Q6KAU8 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg16l2Q6KAU8 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg16l2Q6KAU8 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg16l2Q6KAU8 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg16l2Q6KAU8 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg16l2Q6KAU8 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg16l2Q6KAU8 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg16l2Q6KAU8 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg16l2Q6KAU8 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg16l2Q6KAU8 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg16l2Q6KAU8 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg16l2Q6KAU8 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg16l2Q6KAU8 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg16l2Q6KAU8 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg16l2Q6KAU8 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg16l2Q6KAU8 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg16l2Q6KAU8 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg16l2Q6KAU8 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg16l2Q6KAU8 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg16l2Q6KAU8 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg16l2Q6KAU8 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg16l2Q6KAU8 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg16l2Q6KAU8 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg16l2Q6KAU8 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg16l2Q6KAU8 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg16l2Q6KAU8 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg16l2Q6KAU8 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg16l2Q6KAU8 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg16l2Q6KAU8 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg16l2Q6KAU8 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg16l2Q6KAU8 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg16l2Q6KAU8 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg16l2Q6KAU8 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg16l2Q6KAU8 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg16l2Q6KAU8 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg16l2Q6KAU8 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg16l2Q6KAU8 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg16l2Q6KAU8 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg16l2Q6KAU8 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg16l2Q6KAU8 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg16l2Q6KAU8 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg16l2Q6KAU8 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg16l2Q6KAU8 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg16l2Q6KAU8 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg16l2Q6KAU8 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg16l2Q6KAU8 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg16l2Q6KAU8 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg16l2Q6KAU8 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg16l2Q6KAU8 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg16l2Q6KAU8 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg16l2Q6KAU8 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg16l2Q6KAU8 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg16l2Q6KAU8 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg16l2Q6KAU8 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg16l2Q6KAU8 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg16l2Q6KAU8 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Atg16l2Q6KAU8 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Atg16l2Q6KAU8 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Atg16l2Q6KAU8 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Atg16l2Q6KAU8 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Atg16l2Q6KAU8 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Atg16l2Q6KAU8 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Atg16l2Q6KAU8 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Atg16l2Q6KAU8 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg16l2Q6KAU8 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg16l2Q6KAU8 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg16l2Q6KAU8 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
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Atg16l2Q6KAU8 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg16l2Q6KAU8 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
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Atg16l2Q6KAU8 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg16l2Q6KAU8 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg16l2Q6KAU8 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg16l2Q6KAU8 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg16l2Q6KAU8 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg16l2Q6KAU8 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg16l2Q6KAU8 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg16l2Q6KAU8 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg16l2Q6KAU8 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg16l2Q6KAU8 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg16l2Q6KAU8 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg16l2Q6KAU8 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg16l2Q6KAU8 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg16l2Q6KAU8 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg16l2Q6KAU8 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg16l2Q6KAU8 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg16l2Q6KAU8 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg16l2Q6KAU8 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg16l2Q6KAU8 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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