Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGS0

NEXMIF, Neurite extension and migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEXMIFQ5QGS0 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms