Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1V3

Esf1, ESF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 845 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Esf1Q3V1V3 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Esf1Q3V1V3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Esf1Q3V1V3 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Esf1Q3V1V3 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Esf1Q3V1V3 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Esf1Q3V1V3 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Esf1Q3V1V3 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Esf1Q3V1V3 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Esf1Q3V1V3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Esf1Q3V1V3 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Esf1Q3V1V3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Esf1Q3V1V3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Esf1Q3V1V3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Esf1Q3V1V3 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Esf1Q3V1V3 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Esf1Q3V1V3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Esf1Q3V1V3 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Esf1Q3V1V3 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Esf1Q3V1V3 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Esf1Q3V1V3 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Esf1Q3V1V3 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Esf1Q3V1V3 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Esf1Q3V1V3 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Esf1Q3V1V3 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Esf1Q3V1V3 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Esf1Q3V1V3 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Esf1Q3V1V3 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Esf1Q3V1V3 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Esf1Q3V1V3 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Esf1Q3V1V3 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms