Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Olfr202-203ENSMUST00000217485 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Tas2r141-ps4-201ENSMUST00000205072 946 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Gm3333-202ENSMUST00000221763 1044 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Lyrm2-201ENSMUST00000062802 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Gm39321-203ENSMUST00000217090 1575 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Vmn1r2-201ENSMUST00000105160 921 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Mup-ps10-201ENSMUST00000119626 556 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 1700003H04Rik-203ENSMUST00000178485 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 AC160966.1-201ENSMUST00000217147 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Prl7d1-201ENSMUST00000021776 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 CT010456.2-201ENSMUST00000222665 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Vmn1r79-201ENSMUST00000062811 921 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Gm13487-201ENSMUST00000122240 864 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Klrb1a-202ENSMUST00000171306 989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Gm38154-201ENSMUST00000195444 340 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 AC242269.1-201ENSMUST00000227020 741 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Olfr926-201ENSMUST00000078289 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms