Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PtgfrP43117 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms