Protein–RNA interactions for Protein: P31001

Des, Desmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DesP31001 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DesP31001 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DesP31001 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DesP31001 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DesP31001 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DesP31001 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DesP31001 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DesP31001 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DesP31001 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DesP31001 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DesP31001 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DesP31001 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DesP31001 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DesP31001 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DesP31001 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DesP31001 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DesP31001 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DesP31001 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
DesP31001 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DesP31001 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DesP31001 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
DesP31001 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DesP31001 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
DesP31001 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DesP31001 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DesP31001 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
DesP31001 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DesP31001 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DesP31001 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DesP31001 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DesP31001 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
DesP31001 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DesP31001 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DesP31001 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DesP31001 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DesP31001 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DesP31001 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DesP31001 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DesP31001 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DesP31001 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DesP31001 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
DesP31001 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DesP31001 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
DesP31001 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DesP31001 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DesP31001 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
DesP31001 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
DesP31001 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
DesP31001 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
DesP31001 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
DesP31001 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
DesP31001 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DesP31001 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DesP31001 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DesP31001 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DesP31001 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DesP31001 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DesP31001 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DesP31001 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DesP31001 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DesP31001 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DesP31001 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DesP31001 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DesP31001 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DesP31001 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
DesP31001 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DesP31001 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DesP31001 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
DesP31001 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
DesP31001 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DesP31001 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DesP31001 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DesP31001 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DesP31001 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DesP31001 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DesP31001 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DesP31001 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DesP31001 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DesP31001 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DesP31001 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DesP31001 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DesP31001 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DesP31001 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DesP31001 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DesP31001 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DesP31001 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DesP31001 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DesP31001 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DesP31001 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DesP31001 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DesP31001 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DesP31001 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DesP31001 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DesP31001 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DesP31001 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DesP31001 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DesP31001 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DesP31001 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
DesP31001 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DesP31001 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms