Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5AP29375 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5AP29375 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5AP29375 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5AP29375 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5AP29375 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5AP29375 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5AP29375 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5AP29375 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5AP29375 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5AP29375 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5AP29375 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5AP29375 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5AP29375 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5AP29375 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5AP29375 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5AP29375 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5AP29375 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5AP29375 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5AP29375 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5AP29375 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5AP29375 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5AP29375 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5AP29375 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5AP29375 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5AP29375 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5AP29375 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5AP29375 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5AP29375 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5AP29375 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5AP29375 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5AP29375 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5AP29375 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5AP29375 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5AP29375 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5AP29375 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5AP29375 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5AP29375 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5AP29375 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5AP29375 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5AP29375 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5AP29375 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5AP29375 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5AP29375 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5AP29375 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5AP29375 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5AP29375 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms