Protein–RNA interactions for Protein: P26048

Gabra2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra2P26048 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gabra2P26048 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gabra2P26048 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gabra2P26048 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gabra2P26048 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gabra2P26048 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gabra2P26048 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gabra2P26048 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gabra2P26048 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gabra2P26048 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gabra2P26048 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gabra2P26048 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gabra2P26048 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gabra2P26048 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gabra2P26048 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gabra2P26048 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gabra2P26048 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gabra2P26048 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gabra2P26048 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gabra2P26048 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gabra2P26048 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gabra2P26048 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gabra2P26048 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gabra2P26048 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gabra2P26048 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gabra2P26048 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gabra2P26048 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gabra2P26048 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gabra2P26048 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gabra2P26048 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gabra2P26048 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gabra2P26048 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gabra2P26048 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gabra2P26048 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gabra2P26048 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gabra2P26048 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gabra2P26048 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra2P26048 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra2P26048 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra2P26048 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra2P26048 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra2P26048 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra2P26048 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra2P26048 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra2P26048 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra2P26048 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra2P26048 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra2P26048 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra2P26048 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra2P26048 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra2P26048 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra2P26048 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra2P26048 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra2P26048 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra2P26048 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra2P26048 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra2P26048 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra2P26048 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra2P26048 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra2P26048 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra2P26048 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra2P26048 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra2P26048 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra2P26048 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra2P26048 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra2P26048 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra2P26048 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra2P26048 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra2P26048 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra2P26048 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra2P26048 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra2P26048 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra2P26048 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra2P26048 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra2P26048 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra2P26048 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra2P26048 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra2P26048 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra2P26048 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra2P26048 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra2P26048 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra2P26048 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra2P26048 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra2P26048 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra2P26048 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra2P26048 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra2P26048 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra2P26048 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra2P26048 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra2P26048 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra2P26048 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra2P26048 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra2P26048 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra2P26048 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra2P26048 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra2P26048 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra2P26048 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra2P26048 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra2P26048 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra2P26048 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms