Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms