Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms