Protein–RNA interactions for Protein: A7XUY5

Skint5, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint5A7XUY5 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Skint5A7XUY5 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms