Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Tlr1Q9EPQ1 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Tlr1Q9EPQ1 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlr1Q9EPQ1 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms