Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fundc1Q9DB70 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms