Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

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Length 456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Foxd1Q61345 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Foxd1Q61345 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Foxd1Q61345 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Foxd1Q61345 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Foxd1Q61345 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Foxd1Q61345 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Foxd1Q61345 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Foxd1Q61345 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Foxd1Q61345 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Foxd1Q61345 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Foxd1Q61345 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Foxd1Q61345 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Foxd1Q61345 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Foxd1Q61345 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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