Protein–RNA interactions for Protein: Q4U4S6

Xirp2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp2Q4U4S6 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xirp2Q4U4S6 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Xirp2Q4U4S6 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Xirp2Q4U4S6 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms