Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PrcdQ00LT2 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms