Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.3 ms