Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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