Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC58

SLC24A3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A3Q9HC58 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 AC124242.1-203ENST00000517747 817 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 SNTG1-202ENST00000518864 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC24A3Q9HC58 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms