Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Ctu1Q99J10 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Ctu1Q99J10 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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