Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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