Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms