Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms