Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Myod1P10085 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Myod1P10085 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Myod1P10085 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Myod1P10085 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Myod1P10085 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Myod1P10085 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms