Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Opn1mwO35599 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Opn1mwO35599 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Opn1mwO35599 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Opn1mwO35599 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Opn1mwO35599 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Opn1mwO35599 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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