Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia1B2RXQ2 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms