Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V4

Pck1, Phosphoenolpyruvate carboxykinase, cytosolic [GTP], mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pck1Q9Z2V4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pck1Q9Z2V4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pck1Q9Z2V4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pck1Q9Z2V4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pck1Q9Z2V4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pck1Q9Z2V4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pck1Q9Z2V4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pck1Q9Z2V4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pck1Q9Z2V4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pck1Q9Z2V4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pck1Q9Z2V4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pck1Q9Z2V4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pck1Q9Z2V4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pck1Q9Z2V4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pck1Q9Z2V4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pck1Q9Z2V4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pck1Q9Z2V4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pck1Q9Z2V4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pck1Q9Z2V4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pck1Q9Z2V4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pck1Q9Z2V4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pck1Q9Z2V4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pck1Q9Z2V4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pck1Q9Z2V4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Pck1Q9Z2V4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pck1Q9Z2V4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pck1Q9Z2V4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pck1Q9Z2V4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pck1Q9Z2V4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pck1Q9Z2V4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pck1Q9Z2V4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pck1Q9Z2V4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pck1Q9Z2V4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pck1Q9Z2V4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pck1Q9Z2V4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pck1Q9Z2V4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pck1Q9Z2V4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pck1Q9Z2V4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pck1Q9Z2V4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pck1Q9Z2V4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pck1Q9Z2V4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pck1Q9Z2V4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pck1Q9Z2V4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pck1Q9Z2V4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pck1Q9Z2V4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pck1Q9Z2V4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pck1Q9Z2V4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pck1Q9Z2V4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pck1Q9Z2V4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pck1Q9Z2V4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pck1Q9Z2V4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pck1Q9Z2V4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pck1Q9Z2V4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pck1Q9Z2V4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pck1Q9Z2V4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pck1Q9Z2V4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pck1Q9Z2V4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pck1Q9Z2V4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pck1Q9Z2V4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pck1Q9Z2V4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pck1Q9Z2V4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pck1Q9Z2V4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pck1Q9Z2V4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pck1Q9Z2V4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pck1Q9Z2V4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pck1Q9Z2V4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pck1Q9Z2V4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pck1Q9Z2V4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pck1Q9Z2V4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pck1Q9Z2V4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pck1Q9Z2V4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pck1Q9Z2V4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pck1Q9Z2V4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pck1Q9Z2V4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pck1Q9Z2V4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pck1Q9Z2V4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pck1Q9Z2V4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pck1Q9Z2V4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pck1Q9Z2V4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pck1Q9Z2V4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pck1Q9Z2V4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pck1Q9Z2V4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pck1Q9Z2V4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pck1Q9Z2V4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pck1Q9Z2V4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pck1Q9Z2V4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pck1Q9Z2V4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pck1Q9Z2V4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pck1Q9Z2V4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pck1Q9Z2V4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pck1Q9Z2V4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pck1Q9Z2V4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pck1Q9Z2V4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pck1Q9Z2V4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pck1Q9Z2V4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pck1Q9Z2V4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pck1Q9Z2V4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pck1Q9Z2V4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pck1Q9Z2V4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pck1Q9Z2V4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms