Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mbd1Q9Z2E2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mbd1Q9Z2E2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mbd1Q9Z2E2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mbd1Q9Z2E2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mbd1Q9Z2E2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mbd1Q9Z2E2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mbd1Q9Z2E2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mbd1Q9Z2E2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mbd1Q9Z2E2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mbd1Q9Z2E2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mbd1Q9Z2E2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mbd1Q9Z2E2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Mbd1Q9Z2E2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mbd1Q9Z2E2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mbd1Q9Z2E2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mbd1Q9Z2E2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mbd1Q9Z2E2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mbd1Q9Z2E2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mbd1Q9Z2E2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mbd1Q9Z2E2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mbd1Q9Z2E2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mbd1Q9Z2E2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mbd1Q9Z2E2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mbd1Q9Z2E2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mbd1Q9Z2E2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mbd1Q9Z2E2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mbd1Q9Z2E2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mbd1Q9Z2E2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mbd1Q9Z2E2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mbd1Q9Z2E2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mbd1Q9Z2E2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mbd1Q9Z2E2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mbd1Q9Z2E2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mbd1Q9Z2E2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Mbd1Q9Z2E2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mbd1Q9Z2E2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mbd1Q9Z2E2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mbd1Q9Z2E2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mbd1Q9Z2E2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mbd1Q9Z2E2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mbd1Q9Z2E2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mbd1Q9Z2E2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mbd1Q9Z2E2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mbd1Q9Z2E2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mbd1Q9Z2E2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mbd1Q9Z2E2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mbd1Q9Z2E2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mbd1Q9Z2E2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mbd1Q9Z2E2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mbd1Q9Z2E2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mbd1Q9Z2E2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mbd1Q9Z2E2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mbd1Q9Z2E2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mbd1Q9Z2E2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mbd1Q9Z2E2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mbd1Q9Z2E2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mbd1Q9Z2E2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mbd1Q9Z2E2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mbd1Q9Z2E2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mbd1Q9Z2E2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mbd1Q9Z2E2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mbd1Q9Z2E2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mbd1Q9Z2E2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Mbd1Q9Z2E2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mbd1Q9Z2E2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mbd1Q9Z2E2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Mbd1Q9Z2E2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Mbd1Q9Z2E2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mbd1Q9Z2E2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mbd1Q9Z2E2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mbd1Q9Z2E2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Mbd1Q9Z2E2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Mbd1Q9Z2E2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mbd1Q9Z2E2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mbd1Q9Z2E2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mbd1Q9Z2E2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mbd1Q9Z2E2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Mbd1Q9Z2E2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mbd1Q9Z2E2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mbd1Q9Z2E2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mbd1Q9Z2E2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mbd1Q9Z2E2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mbd1Q9Z2E2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mbd1Q9Z2E2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mbd1Q9Z2E2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mbd1Q9Z2E2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mbd1Q9Z2E2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mbd1Q9Z2E2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Mbd1Q9Z2E2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mbd1Q9Z2E2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mbd1Q9Z2E2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mbd1Q9Z2E2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mbd1Q9Z2E2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mbd1Q9Z2E2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mbd1Q9Z2E2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mbd1Q9Z2E2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Mbd1Q9Z2E2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mbd1Q9Z2E2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mbd1Q9Z2E2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms