Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z108

Stau1, Double-stranded RNA-binding protein Staufen homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stau1Q9Z108 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Stau1Q9Z108 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stau1Q9Z108 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stau1Q9Z108 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stau1Q9Z108 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stau1Q9Z108 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stau1Q9Z108 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Stau1Q9Z108 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stau1Q9Z108 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stau1Q9Z108 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stau1Q9Z108 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stau1Q9Z108 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stau1Q9Z108 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stau1Q9Z108 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stau1Q9Z108 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stau1Q9Z108 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stau1Q9Z108 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stau1Q9Z108 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stau1Q9Z108 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stau1Q9Z108 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stau1Q9Z108 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Stau1Q9Z108 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Stau1Q9Z108 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stau1Q9Z108 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stau1Q9Z108 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stau1Q9Z108 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Stau1Q9Z108 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stau1Q9Z108 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stau1Q9Z108 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Stau1Q9Z108 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Stau1Q9Z108 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stau1Q9Z108 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stau1Q9Z108 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stau1Q9Z108 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stau1Q9Z108 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stau1Q9Z108 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Stau1Q9Z108 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stau1Q9Z108 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stau1Q9Z108 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stau1Q9Z108 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stau1Q9Z108 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stau1Q9Z108 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stau1Q9Z108 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stau1Q9Z108 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stau1Q9Z108 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stau1Q9Z108 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stau1Q9Z108 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stau1Q9Z108 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stau1Q9Z108 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stau1Q9Z108 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Stau1Q9Z108 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stau1Q9Z108 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stau1Q9Z108 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stau1Q9Z108 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stau1Q9Z108 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stau1Q9Z108 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stau1Q9Z108 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stau1Q9Z108 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stau1Q9Z108 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stau1Q9Z108 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stau1Q9Z108 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stau1Q9Z108 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stau1Q9Z108 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stau1Q9Z108 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stau1Q9Z108 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stau1Q9Z108 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stau1Q9Z108 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stau1Q9Z108 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stau1Q9Z108 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stau1Q9Z108 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stau1Q9Z108 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stau1Q9Z108 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stau1Q9Z108 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stau1Q9Z108 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stau1Q9Z108 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Stau1Q9Z108 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Stau1Q9Z108 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stau1Q9Z108 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stau1Q9Z108 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stau1Q9Z108 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stau1Q9Z108 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stau1Q9Z108 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stau1Q9Z108 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stau1Q9Z108 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stau1Q9Z108 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stau1Q9Z108 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stau1Q9Z108 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stau1Q9Z108 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stau1Q9Z108 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stau1Q9Z108 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stau1Q9Z108 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stau1Q9Z108 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stau1Q9Z108 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stau1Q9Z108 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stau1Q9Z108 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stau1Q9Z108 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stau1Q9Z108 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stau1Q9Z108 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stau1Q9Z108 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stau1Q9Z108 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms