Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NgfrQ9Z0W1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NgfrQ9Z0W1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NgfrQ9Z0W1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NgfrQ9Z0W1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NgfrQ9Z0W1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NgfrQ9Z0W1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NgfrQ9Z0W1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NgfrQ9Z0W1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NgfrQ9Z0W1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NgfrQ9Z0W1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NgfrQ9Z0W1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NgfrQ9Z0W1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NgfrQ9Z0W1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NgfrQ9Z0W1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NgfrQ9Z0W1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NgfrQ9Z0W1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NgfrQ9Z0W1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NgfrQ9Z0W1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NgfrQ9Z0W1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NgfrQ9Z0W1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NgfrQ9Z0W1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NgfrQ9Z0W1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NgfrQ9Z0W1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NgfrQ9Z0W1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NgfrQ9Z0W1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NgfrQ9Z0W1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NgfrQ9Z0W1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NgfrQ9Z0W1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NgfrQ9Z0W1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NgfrQ9Z0W1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NgfrQ9Z0W1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NgfrQ9Z0W1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NgfrQ9Z0W1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NgfrQ9Z0W1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NgfrQ9Z0W1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NgfrQ9Z0W1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NgfrQ9Z0W1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NgfrQ9Z0W1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NgfrQ9Z0W1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NgfrQ9Z0W1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NgfrQ9Z0W1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NgfrQ9Z0W1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NgfrQ9Z0W1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NgfrQ9Z0W1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NgfrQ9Z0W1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NgfrQ9Z0W1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NgfrQ9Z0W1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NgfrQ9Z0W1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NgfrQ9Z0W1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NgfrQ9Z0W1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NgfrQ9Z0W1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NgfrQ9Z0W1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NgfrQ9Z0W1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NgfrQ9Z0W1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NgfrQ9Z0W1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NgfrQ9Z0W1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NgfrQ9Z0W1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NgfrQ9Z0W1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NgfrQ9Z0W1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NgfrQ9Z0W1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NgfrQ9Z0W1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NgfrQ9Z0W1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NgfrQ9Z0W1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NgfrQ9Z0W1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NgfrQ9Z0W1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NgfrQ9Z0W1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
NgfrQ9Z0W1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
NgfrQ9Z0W1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
NgfrQ9Z0W1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
NgfrQ9Z0W1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NgfrQ9Z0W1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NgfrQ9Z0W1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NgfrQ9Z0W1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NgfrQ9Z0W1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NgfrQ9Z0W1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NgfrQ9Z0W1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NgfrQ9Z0W1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NgfrQ9Z0W1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NgfrQ9Z0W1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NgfrQ9Z0W1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NgfrQ9Z0W1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NgfrQ9Z0W1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NgfrQ9Z0W1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NgfrQ9Z0W1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NgfrQ9Z0W1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NgfrQ9Z0W1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NgfrQ9Z0W1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NgfrQ9Z0W1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NgfrQ9Z0W1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NgfrQ9Z0W1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NgfrQ9Z0W1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NgfrQ9Z0W1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NgfrQ9Z0W1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NgfrQ9Z0W1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NgfrQ9Z0W1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NgfrQ9Z0W1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NgfrQ9Z0W1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NgfrQ9Z0W1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NgfrQ9Z0W1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms