Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pmfbp1Q9WVQ0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pmfbp1Q9WVQ0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pmfbp1Q9WVQ0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Pmfbp1Q9WVQ0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pmfbp1Q9WVQ0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pmfbp1Q9WVQ0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pmfbp1Q9WVQ0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Pmfbp1Q9WVQ0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pmfbp1Q9WVQ0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pmfbp1Q9WVQ0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pmfbp1Q9WVQ0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pmfbp1Q9WVQ0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pmfbp1Q9WVQ0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pmfbp1Q9WVQ0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pmfbp1Q9WVQ0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pmfbp1Q9WVQ0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pmfbp1Q9WVQ0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pmfbp1Q9WVQ0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pmfbp1Q9WVQ0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pmfbp1Q9WVQ0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pmfbp1Q9WVQ0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pmfbp1Q9WVQ0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pmfbp1Q9WVQ0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pmfbp1Q9WVQ0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pmfbp1Q9WVQ0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pmfbp1Q9WVQ0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pmfbp1Q9WVQ0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pmfbp1Q9WVQ0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pmfbp1Q9WVQ0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pmfbp1Q9WVQ0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pmfbp1Q9WVQ0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pmfbp1Q9WVQ0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Pmfbp1Q9WVQ0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pmfbp1Q9WVQ0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pmfbp1Q9WVQ0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pmfbp1Q9WVQ0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pmfbp1Q9WVQ0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pmfbp1Q9WVQ0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pmfbp1Q9WVQ0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pmfbp1Q9WVQ0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Pmfbp1Q9WVQ0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pmfbp1Q9WVQ0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pmfbp1Q9WVQ0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pmfbp1Q9WVQ0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pmfbp1Q9WVQ0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pmfbp1Q9WVQ0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pmfbp1Q9WVQ0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pmfbp1Q9WVQ0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pmfbp1Q9WVQ0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pmfbp1Q9WVQ0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pmfbp1Q9WVQ0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pmfbp1Q9WVQ0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pmfbp1Q9WVQ0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pmfbp1Q9WVQ0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pmfbp1Q9WVQ0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pmfbp1Q9WVQ0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pmfbp1Q9WVQ0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pmfbp1Q9WVQ0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pmfbp1Q9WVQ0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pmfbp1Q9WVQ0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pmfbp1Q9WVQ0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pmfbp1Q9WVQ0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pmfbp1Q9WVQ0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pmfbp1Q9WVQ0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pmfbp1Q9WVQ0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pmfbp1Q9WVQ0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pmfbp1Q9WVQ0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pmfbp1Q9WVQ0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pmfbp1Q9WVQ0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pmfbp1Q9WVQ0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pmfbp1Q9WVQ0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pmfbp1Q9WVQ0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pmfbp1Q9WVQ0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pmfbp1Q9WVQ0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pmfbp1Q9WVQ0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pmfbp1Q9WVQ0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Pmfbp1Q9WVQ0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pmfbp1Q9WVQ0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pmfbp1Q9WVQ0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pmfbp1Q9WVQ0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms