Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVK8

Cyp46a1, Cholesterol 24-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp46a1Q9WVK8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cyp46a1Q9WVK8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cyp46a1Q9WVK8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cyp46a1Q9WVK8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cyp46a1Q9WVK8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cyp46a1Q9WVK8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cyp46a1Q9WVK8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cyp46a1Q9WVK8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cyp46a1Q9WVK8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cyp46a1Q9WVK8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cyp46a1Q9WVK8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cyp46a1Q9WVK8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cyp46a1Q9WVK8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Cyp46a1Q9WVK8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cyp46a1Q9WVK8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cyp46a1Q9WVK8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cyp46a1Q9WVK8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cyp46a1Q9WVK8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cyp46a1Q9WVK8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cyp46a1Q9WVK8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cyp46a1Q9WVK8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cyp46a1Q9WVK8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cyp46a1Q9WVK8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cyp46a1Q9WVK8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cyp46a1Q9WVK8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cyp46a1Q9WVK8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cyp46a1Q9WVK8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cyp46a1Q9WVK8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Cyp46a1Q9WVK8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Cyp46a1Q9WVK8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cyp46a1Q9WVK8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cyp46a1Q9WVK8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cyp46a1Q9WVK8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cyp46a1Q9WVK8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cyp46a1Q9WVK8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cyp46a1Q9WVK8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cyp46a1Q9WVK8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cyp46a1Q9WVK8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cyp46a1Q9WVK8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cyp46a1Q9WVK8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cyp46a1Q9WVK8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cyp46a1Q9WVK8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cyp46a1Q9WVK8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cyp46a1Q9WVK8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cyp46a1Q9WVK8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cyp46a1Q9WVK8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cyp46a1Q9WVK8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cyp46a1Q9WVK8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cyp46a1Q9WVK8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cyp46a1Q9WVK8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cyp46a1Q9WVK8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Cyp46a1Q9WVK8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cyp46a1Q9WVK8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cyp46a1Q9WVK8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Cyp46a1Q9WVK8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cyp46a1Q9WVK8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cyp46a1Q9WVK8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cyp46a1Q9WVK8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cyp46a1Q9WVK8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cyp46a1Q9WVK8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cyp46a1Q9WVK8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cyp46a1Q9WVK8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cyp46a1Q9WVK8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cyp46a1Q9WVK8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cyp46a1Q9WVK8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cyp46a1Q9WVK8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cyp46a1Q9WVK8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cyp46a1Q9WVK8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cyp46a1Q9WVK8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cyp46a1Q9WVK8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cyp46a1Q9WVK8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cyp46a1Q9WVK8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cyp46a1Q9WVK8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cyp46a1Q9WVK8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cyp46a1Q9WVK8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cyp46a1Q9WVK8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cyp46a1Q9WVK8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cyp46a1Q9WVK8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cyp46a1Q9WVK8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cyp46a1Q9WVK8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cyp46a1Q9WVK8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cyp46a1Q9WVK8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cyp46a1Q9WVK8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cyp46a1Q9WVK8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cyp46a1Q9WVK8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cyp46a1Q9WVK8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cyp46a1Q9WVK8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cyp46a1Q9WVK8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cyp46a1Q9WVK8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cyp46a1Q9WVK8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cyp46a1Q9WVK8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cyp46a1Q9WVK8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cyp46a1Q9WVK8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cyp46a1Q9WVK8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cyp46a1Q9WVK8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Cyp46a1Q9WVK8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Cyp46a1Q9WVK8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cyp46a1Q9WVK8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cyp46a1Q9WVK8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cyp46a1Q9WVK8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms