Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubd1Q9R1K7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubd1Q9R1K7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubd1Q9R1K7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubd1Q9R1K7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubd1Q9R1K7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tubd1Q9R1K7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tubd1Q9R1K7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tubd1Q9R1K7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tubd1Q9R1K7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubd1Q9R1K7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubd1Q9R1K7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubd1Q9R1K7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubd1Q9R1K7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubd1Q9R1K7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubd1Q9R1K7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubd1Q9R1K7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubd1Q9R1K7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubd1Q9R1K7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubd1Q9R1K7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubd1Q9R1K7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tubd1Q9R1K7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tubd1Q9R1K7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tubd1Q9R1K7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tubd1Q9R1K7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tubd1Q9R1K7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tubd1Q9R1K7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tubd1Q9R1K7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tubd1Q9R1K7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tubd1Q9R1K7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Tubd1Q9R1K7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tubd1Q9R1K7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tubd1Q9R1K7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tubd1Q9R1K7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubd1Q9R1K7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubd1Q9R1K7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubd1Q9R1K7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubd1Q9R1K7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubd1Q9R1K7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubd1Q9R1K7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubd1Q9R1K7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubd1Q9R1K7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubd1Q9R1K7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubd1Q9R1K7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubd1Q9R1K7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubd1Q9R1K7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubd1Q9R1K7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubd1Q9R1K7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubd1Q9R1K7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubd1Q9R1K7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubd1Q9R1K7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubd1Q9R1K7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubd1Q9R1K7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubd1Q9R1K7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubd1Q9R1K7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubd1Q9R1K7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubd1Q9R1K7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubd1Q9R1K7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubd1Q9R1K7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubd1Q9R1K7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubd1Q9R1K7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubd1Q9R1K7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubd1Q9R1K7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubd1Q9R1K7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubd1Q9R1K7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubd1Q9R1K7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubd1Q9R1K7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tubd1Q9R1K7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tubd1Q9R1K7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tubd1Q9R1K7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tubd1Q9R1K7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tubd1Q9R1K7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubd1Q9R1K7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubd1Q9R1K7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubd1Q9R1K7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubd1Q9R1K7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubd1Q9R1K7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubd1Q9R1K7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubd1Q9R1K7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubd1Q9R1K7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubd1Q9R1K7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubd1Q9R1K7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubd1Q9R1K7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tubd1Q9R1K7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tubd1Q9R1K7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tubd1Q9R1K7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tubd1Q9R1K7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tubd1Q9R1K7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tubd1Q9R1K7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tubd1Q9R1K7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tubd1Q9R1K7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tubd1Q9R1K7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Tubd1Q9R1K7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tubd1Q9R1K7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tubd1Q9R1K7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tubd1Q9R1K7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tubd1Q9R1K7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tubd1Q9R1K7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tubd1Q9R1K7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tubd1Q9R1K7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms