Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1C0

Taf7, Transcription initiation factor TFIID subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf7Q9R1C0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Taf7Q9R1C0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Taf7Q9R1C0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Taf7Q9R1C0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Taf7Q9R1C0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Taf7Q9R1C0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Taf7Q9R1C0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Taf7Q9R1C0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Taf7Q9R1C0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Taf7Q9R1C0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Taf7Q9R1C0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Taf7Q9R1C0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Taf7Q9R1C0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Taf7Q9R1C0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Taf7Q9R1C0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Taf7Q9R1C0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Taf7Q9R1C0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Taf7Q9R1C0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Taf7Q9R1C0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Taf7Q9R1C0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Taf7Q9R1C0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Taf7Q9R1C0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Taf7Q9R1C0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Taf7Q9R1C0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Taf7Q9R1C0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Taf7Q9R1C0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Taf7Q9R1C0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Taf7Q9R1C0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Taf7Q9R1C0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Taf7Q9R1C0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Taf7Q9R1C0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Taf7Q9R1C0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Taf7Q9R1C0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Taf7Q9R1C0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Taf7Q9R1C0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Taf7Q9R1C0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Taf7Q9R1C0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Taf7Q9R1C0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Taf7Q9R1C0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Taf7Q9R1C0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Taf7Q9R1C0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Taf7Q9R1C0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Taf7Q9R1C0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Taf7Q9R1C0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Taf7Q9R1C0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Taf7Q9R1C0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Taf7Q9R1C0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Taf7Q9R1C0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Taf7Q9R1C0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Taf7Q9R1C0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Taf7Q9R1C0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Taf7Q9R1C0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Taf7Q9R1C0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Taf7Q9R1C0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Taf7Q9R1C0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Taf7Q9R1C0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Taf7Q9R1C0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Taf7Q9R1C0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Taf7Q9R1C0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Taf7Q9R1C0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Taf7Q9R1C0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Taf7Q9R1C0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Taf7Q9R1C0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Taf7Q9R1C0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Taf7Q9R1C0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Taf7Q9R1C0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Taf7Q9R1C0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Taf7Q9R1C0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Taf7Q9R1C0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Taf7Q9R1C0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Taf7Q9R1C0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Taf7Q9R1C0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Taf7Q9R1C0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Taf7Q9R1C0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Taf7Q9R1C0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Taf7Q9R1C0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Taf7Q9R1C0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Taf7Q9R1C0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Taf7Q9R1C0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Taf7Q9R1C0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Taf7Q9R1C0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Taf7Q9R1C0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Taf7Q9R1C0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Taf7Q9R1C0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Taf7Q9R1C0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Taf7Q9R1C0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Taf7Q9R1C0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Taf7Q9R1C0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Taf7Q9R1C0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Taf7Q9R1C0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Taf7Q9R1C0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Taf7Q9R1C0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Taf7Q9R1C0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Taf7Q9R1C0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Taf7Q9R1C0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Taf7Q9R1C0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Taf7Q9R1C0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Taf7Q9R1C0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Taf7Q9R1C0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Taf7Q9R1C0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms