Protein–RNA interactions for Protein: Q9R078

Prkab1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab1Q9R078 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prkab1Q9R078 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prkab1Q9R078 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prkab1Q9R078 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prkab1Q9R078 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Prkab1Q9R078 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prkab1Q9R078 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prkab1Q9R078 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prkab1Q9R078 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prkab1Q9R078 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prkab1Q9R078 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prkab1Q9R078 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prkab1Q9R078 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Prkab1Q9R078 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prkab1Q9R078 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prkab1Q9R078 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prkab1Q9R078 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prkab1Q9R078 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prkab1Q9R078 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prkab1Q9R078 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prkab1Q9R078 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prkab1Q9R078 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prkab1Q9R078 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prkab1Q9R078 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Prkab1Q9R078 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Prkab1Q9R078 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prkab1Q9R078 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prkab1Q9R078 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prkab1Q9R078 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prkab1Q9R078 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prkab1Q9R078 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prkab1Q9R078 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prkab1Q9R078 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prkab1Q9R078 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prkab1Q9R078 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prkab1Q9R078 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prkab1Q9R078 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Prkab1Q9R078 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prkab1Q9R078 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prkab1Q9R078 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prkab1Q9R078 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prkab1Q9R078 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prkab1Q9R078 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Prkab1Q9R078 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Prkab1Q9R078 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prkab1Q9R078 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prkab1Q9R078 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prkab1Q9R078 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Prkab1Q9R078 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prkab1Q9R078 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prkab1Q9R078 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prkab1Q9R078 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prkab1Q9R078 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prkab1Q9R078 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Prkab1Q9R078 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prkab1Q9R078 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prkab1Q9R078 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prkab1Q9R078 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prkab1Q9R078 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prkab1Q9R078 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prkab1Q9R078 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Prkab1Q9R078 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prkab1Q9R078 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prkab1Q9R078 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prkab1Q9R078 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prkab1Q9R078 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prkab1Q9R078 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prkab1Q9R078 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prkab1Q9R078 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prkab1Q9R078 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prkab1Q9R078 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prkab1Q9R078 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prkab1Q9R078 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prkab1Q9R078 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prkab1Q9R078 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prkab1Q9R078 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Prkab1Q9R078 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Prkab1Q9R078 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prkab1Q9R078 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prkab1Q9R078 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prkab1Q9R078 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prkab1Q9R078 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prkab1Q9R078 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prkab1Q9R078 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prkab1Q9R078 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prkab1Q9R078 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prkab1Q9R078 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prkab1Q9R078 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prkab1Q9R078 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prkab1Q9R078 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prkab1Q9R078 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prkab1Q9R078 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prkab1Q9R078 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prkab1Q9R078 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prkab1Q9R078 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prkab1Q9R078 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prkab1Q9R078 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prkab1Q9R078 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prkab1Q9R078 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prkab1Q9R078 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms