Protein–RNA interactions for Protein: Q9R059

Fhl3, Four and a half LIM domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhl3Q9R059 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fhl3Q9R059 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fhl3Q9R059 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fhl3Q9R059 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Fhl3Q9R059 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fhl3Q9R059 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fhl3Q9R059 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fhl3Q9R059 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fhl3Q9R059 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fhl3Q9R059 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fhl3Q9R059 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fhl3Q9R059 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fhl3Q9R059 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fhl3Q9R059 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fhl3Q9R059 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fhl3Q9R059 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fhl3Q9R059 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fhl3Q9R059 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Fhl3Q9R059 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fhl3Q9R059 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fhl3Q9R059 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fhl3Q9R059 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Fhl3Q9R059 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fhl3Q9R059 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fhl3Q9R059 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fhl3Q9R059 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fhl3Q9R059 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fhl3Q9R059 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fhl3Q9R059 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fhl3Q9R059 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fhl3Q9R059 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fhl3Q9R059 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fhl3Q9R059 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fhl3Q9R059 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fhl3Q9R059 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fhl3Q9R059 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fhl3Q9R059 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fhl3Q9R059 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fhl3Q9R059 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fhl3Q9R059 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fhl3Q9R059 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fhl3Q9R059 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fhl3Q9R059 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fhl3Q9R059 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fhl3Q9R059 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fhl3Q9R059 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fhl3Q9R059 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fhl3Q9R059 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fhl3Q9R059 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fhl3Q9R059 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fhl3Q9R059 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fhl3Q9R059 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Fhl3Q9R059 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Fhl3Q9R059 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fhl3Q9R059 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Fhl3Q9R059 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fhl3Q9R059 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fhl3Q9R059 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fhl3Q9R059 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fhl3Q9R059 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fhl3Q9R059 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fhl3Q9R059 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fhl3Q9R059 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fhl3Q9R059 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fhl3Q9R059 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fhl3Q9R059 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fhl3Q9R059 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fhl3Q9R059 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fhl3Q9R059 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fhl3Q9R059 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fhl3Q9R059 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fhl3Q9R059 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fhl3Q9R059 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fhl3Q9R059 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fhl3Q9R059 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fhl3Q9R059 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fhl3Q9R059 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fhl3Q9R059 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fhl3Q9R059 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fhl3Q9R059 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fhl3Q9R059 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fhl3Q9R059 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fhl3Q9R059 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fhl3Q9R059 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fhl3Q9R059 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fhl3Q9R059 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fhl3Q9R059 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fhl3Q9R059 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fhl3Q9R059 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fhl3Q9R059 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fhl3Q9R059 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fhl3Q9R059 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fhl3Q9R059 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fhl3Q9R059 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fhl3Q9R059 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fhl3Q9R059 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fhl3Q9R059 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fhl3Q9R059 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fhl3Q9R059 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fhl3Q9R059 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms