Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ11

Exo1, Exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo1Q9QZ11 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Exo1Q9QZ11 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Exo1Q9QZ11 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Exo1Q9QZ11 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Exo1Q9QZ11 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Exo1Q9QZ11 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Exo1Q9QZ11 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Exo1Q9QZ11 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Exo1Q9QZ11 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Exo1Q9QZ11 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Exo1Q9QZ11 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Exo1Q9QZ11 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Exo1Q9QZ11 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Exo1Q9QZ11 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Exo1Q9QZ11 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Exo1Q9QZ11 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Exo1Q9QZ11 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Exo1Q9QZ11 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Exo1Q9QZ11 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Exo1Q9QZ11 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Exo1Q9QZ11 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Exo1Q9QZ11 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Exo1Q9QZ11 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Exo1Q9QZ11 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Exo1Q9QZ11 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Exo1Q9QZ11 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Exo1Q9QZ11 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Exo1Q9QZ11 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Exo1Q9QZ11 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Exo1Q9QZ11 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Exo1Q9QZ11 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Exo1Q9QZ11 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Exo1Q9QZ11 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Exo1Q9QZ11 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Exo1Q9QZ11 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Exo1Q9QZ11 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Exo1Q9QZ11 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Exo1Q9QZ11 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Exo1Q9QZ11 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Exo1Q9QZ11 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Exo1Q9QZ11 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Exo1Q9QZ11 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Exo1Q9QZ11 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Exo1Q9QZ11 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Exo1Q9QZ11 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Exo1Q9QZ11 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Exo1Q9QZ11 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Exo1Q9QZ11 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Exo1Q9QZ11 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Exo1Q9QZ11 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Exo1Q9QZ11 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Exo1Q9QZ11 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Exo1Q9QZ11 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Exo1Q9QZ11 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Exo1Q9QZ11 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Exo1Q9QZ11 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Exo1Q9QZ11 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Exo1Q9QZ11 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Exo1Q9QZ11 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Exo1Q9QZ11 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Exo1Q9QZ11 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Exo1Q9QZ11 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Exo1Q9QZ11 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Exo1Q9QZ11 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Exo1Q9QZ11 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Exo1Q9QZ11 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Exo1Q9QZ11 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Exo1Q9QZ11 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Exo1Q9QZ11 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Exo1Q9QZ11 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Exo1Q9QZ11 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Exo1Q9QZ11 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Exo1Q9QZ11 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Exo1Q9QZ11 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Exo1Q9QZ11 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Exo1Q9QZ11 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Exo1Q9QZ11 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Exo1Q9QZ11 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Exo1Q9QZ11 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Exo1Q9QZ11 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Exo1Q9QZ11 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Exo1Q9QZ11 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Exo1Q9QZ11 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Exo1Q9QZ11 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Exo1Q9QZ11 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Exo1Q9QZ11 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Exo1Q9QZ11 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Exo1Q9QZ11 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Exo1Q9QZ11 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Exo1Q9QZ11 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Exo1Q9QZ11 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Exo1Q9QZ11 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Exo1Q9QZ11 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Exo1Q9QZ11 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Exo1Q9QZ11 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Exo1Q9QZ11 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Exo1Q9QZ11 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Exo1Q9QZ11 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Exo1Q9QZ11 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Exo1Q9QZ11 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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