Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PdcQ9QW08 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PdcQ9QW08 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PdcQ9QW08 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PdcQ9QW08 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PdcQ9QW08 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PdcQ9QW08 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PdcQ9QW08 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PdcQ9QW08 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PdcQ9QW08 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PdcQ9QW08 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PdcQ9QW08 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PdcQ9QW08 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PdcQ9QW08 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PdcQ9QW08 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PdcQ9QW08 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PdcQ9QW08 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PdcQ9QW08 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PdcQ9QW08 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PdcQ9QW08 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PdcQ9QW08 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PdcQ9QW08 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PdcQ9QW08 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PdcQ9QW08 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PdcQ9QW08 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PdcQ9QW08 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PdcQ9QW08 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PdcQ9QW08 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PdcQ9QW08 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PdcQ9QW08 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PdcQ9QW08 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PdcQ9QW08 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PdcQ9QW08 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PdcQ9QW08 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PdcQ9QW08 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PdcQ9QW08 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PdcQ9QW08 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PdcQ9QW08 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PdcQ9QW08 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PdcQ9QW08 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PdcQ9QW08 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PdcQ9QW08 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PdcQ9QW08 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PdcQ9QW08 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PdcQ9QW08 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PdcQ9QW08 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PdcQ9QW08 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PdcQ9QW08 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PdcQ9QW08 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PdcQ9QW08 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PdcQ9QW08 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PdcQ9QW08 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PdcQ9QW08 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PdcQ9QW08 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PdcQ9QW08 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PdcQ9QW08 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PdcQ9QW08 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PdcQ9QW08 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PdcQ9QW08 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PdcQ9QW08 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PdcQ9QW08 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PdcQ9QW08 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PdcQ9QW08 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PdcQ9QW08 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PdcQ9QW08 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PdcQ9QW08 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PdcQ9QW08 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PdcQ9QW08 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PdcQ9QW08 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PdcQ9QW08 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PdcQ9QW08 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PdcQ9QW08 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PdcQ9QW08 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PdcQ9QW08 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PdcQ9QW08 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PdcQ9QW08 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PdcQ9QW08 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PdcQ9QW08 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PdcQ9QW08 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PdcQ9QW08 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PdcQ9QW08 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PdcQ9QW08 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PdcQ9QW08 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PdcQ9QW08 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PdcQ9QW08 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PdcQ9QW08 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PdcQ9QW08 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PdcQ9QW08 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PdcQ9QW08 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PdcQ9QW08 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PdcQ9QW08 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PdcQ9QW08 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PdcQ9QW08 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PdcQ9QW08 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PdcQ9QW08 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PdcQ9QW08 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PdcQ9QW08 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PdcQ9QW08 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PdcQ9QW08 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PdcQ9QW08 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms