Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cln8Q9QUK3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cln8Q9QUK3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cln8Q9QUK3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cln8Q9QUK3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cln8Q9QUK3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cln8Q9QUK3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cln8Q9QUK3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cln8Q9QUK3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cln8Q9QUK3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cln8Q9QUK3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cln8Q9QUK3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cln8Q9QUK3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cln8Q9QUK3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cln8Q9QUK3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cln8Q9QUK3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cln8Q9QUK3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cln8Q9QUK3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cln8Q9QUK3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cln8Q9QUK3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cln8Q9QUK3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cln8Q9QUK3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cln8Q9QUK3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cln8Q9QUK3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cln8Q9QUK3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cln8Q9QUK3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cln8Q9QUK3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cln8Q9QUK3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cln8Q9QUK3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cln8Q9QUK3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cln8Q9QUK3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cln8Q9QUK3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cln8Q9QUK3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cln8Q9QUK3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cln8Q9QUK3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cln8Q9QUK3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cln8Q9QUK3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cln8Q9QUK3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cln8Q9QUK3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cln8Q9QUK3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cln8Q9QUK3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cln8Q9QUK3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cln8Q9QUK3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cln8Q9QUK3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cln8Q9QUK3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cln8Q9QUK3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cln8Q9QUK3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cln8Q9QUK3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cln8Q9QUK3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cln8Q9QUK3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cln8Q9QUK3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cln8Q9QUK3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cln8Q9QUK3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cln8Q9QUK3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cln8Q9QUK3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cln8Q9QUK3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cln8Q9QUK3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cln8Q9QUK3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cln8Q9QUK3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cln8Q9QUK3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cln8Q9QUK3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cln8Q9QUK3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cln8Q9QUK3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cln8Q9QUK3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cln8Q9QUK3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cln8Q9QUK3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cln8Q9QUK3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cln8Q9QUK3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cln8Q9QUK3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cln8Q9QUK3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cln8Q9QUK3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cln8Q9QUK3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cln8Q9QUK3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cln8Q9QUK3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Cln8Q9QUK3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cln8Q9QUK3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cln8Q9QUK3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cln8Q9QUK3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cln8Q9QUK3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Cln8Q9QUK3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cln8Q9QUK3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cln8Q9QUK3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cln8Q9QUK3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cln8Q9QUK3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cln8Q9QUK3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cln8Q9QUK3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cln8Q9QUK3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cln8Q9QUK3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cln8Q9QUK3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cln8Q9QUK3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cln8Q9QUK3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cln8Q9QUK3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cln8Q9QUK3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cln8Q9QUK3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cln8Q9QUK3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cln8Q9QUK3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cln8Q9QUK3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cln8Q9QUK3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cln8Q9QUK3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cln8Q9QUK3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms