Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mrpl39Q9JKF7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mrpl39Q9JKF7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mrpl39Q9JKF7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mrpl39Q9JKF7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mrpl39Q9JKF7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mrpl39Q9JKF7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mrpl39Q9JKF7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mrpl39Q9JKF7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mrpl39Q9JKF7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mrpl39Q9JKF7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Mrpl39Q9JKF7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Mrpl39Q9JKF7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mrpl39Q9JKF7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mrpl39Q9JKF7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mrpl39Q9JKF7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mrpl39Q9JKF7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mrpl39Q9JKF7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mrpl39Q9JKF7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mrpl39Q9JKF7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mrpl39Q9JKF7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mrpl39Q9JKF7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mrpl39Q9JKF7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mrpl39Q9JKF7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mrpl39Q9JKF7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrpl39Q9JKF7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrpl39Q9JKF7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrpl39Q9JKF7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrpl39Q9JKF7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrpl39Q9JKF7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrpl39Q9JKF7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrpl39Q9JKF7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrpl39Q9JKF7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrpl39Q9JKF7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrpl39Q9JKF7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrpl39Q9JKF7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrpl39Q9JKF7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrpl39Q9JKF7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrpl39Q9JKF7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrpl39Q9JKF7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrpl39Q9JKF7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrpl39Q9JKF7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrpl39Q9JKF7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrpl39Q9JKF7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrpl39Q9JKF7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrpl39Q9JKF7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrpl39Q9JKF7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrpl39Q9JKF7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrpl39Q9JKF7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrpl39Q9JKF7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrpl39Q9JKF7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrpl39Q9JKF7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrpl39Q9JKF7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrpl39Q9JKF7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrpl39Q9JKF7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrpl39Q9JKF7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrpl39Q9JKF7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrpl39Q9JKF7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrpl39Q9JKF7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrpl39Q9JKF7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrpl39Q9JKF7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrpl39Q9JKF7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrpl39Q9JKF7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrpl39Q9JKF7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl39Q9JKF7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl39Q9JKF7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl39Q9JKF7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl39Q9JKF7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl39Q9JKF7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl39Q9JKF7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl39Q9JKF7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl39Q9JKF7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl39Q9JKF7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl39Q9JKF7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl39Q9JKF7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl39Q9JKF7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl39Q9JKF7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mrpl39Q9JKF7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mrpl39Q9JKF7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mrpl39Q9JKF7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl39Q9JKF7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl39Q9JKF7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl39Q9JKF7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl39Q9JKF7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl39Q9JKF7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl39Q9JKF7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl39Q9JKF7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl39Q9JKF7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl39Q9JKF7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl39Q9JKF7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl39Q9JKF7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl39Q9JKF7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl39Q9JKF7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl39Q9JKF7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl39Q9JKF7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl39Q9JKF7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl39Q9JKF7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl39Q9JKF7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl39Q9JKF7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms